BMKCloud Log in
ሰንደቅ-03

ምርቶች

ንፅፅር ጂኖሚክስ

ንጽጽር ጂኖም ማለት በጥሬው የተለያዩ ዝርያዎችን ሙሉ የጂኖም ቅደም ተከተሎችን እና አወቃቀሮችን ማወዳደር ማለት ነው።ይህ ተግሣጽ ዓላማው የዝርያ ዝግመተ ለውጥን፣ የጂን ተግባርን፣ የጂን መቆጣጠሪያ ዘዴን በጂኖም ደረጃ በመለየት የተከታታይ አወቃቀሮችን እና ንጥረ ነገሮችን በመለየት በተለያዩ ዝርያዎች መካከል የተጠበቁ ወይም የሚለያዩ ናቸው።የተለመደው የንጽጽር ጂኖሚክስ ጥናት በጂን ቤተሰብ፣ በዝግመተ ለውጥ እድገት፣ በጠቅላላ ጂኖም ማባዛት፣ የተመረጠ ግፊት፣ ወዘተ ያሉትን ትንታኔዎች ያካትታል።


የአገልግሎት ዝርዝሮች

የማሳያ ውጤቶች

የጉዳይ ጥናት

የአገልግሎት ጥቅሞች

1 ንጽጽር-ጂኖሚክስ

● በጣም የተለመዱትን ስምንት ትንታኔዎችን የያዘ አጠቃላይ ትንታኔዎች ጥቅል

● በውጤቶች ላይ ዝርዝር እና በቀላሉ ሊረዳ የሚችል ትርጓሜ በመተንተን ከፍተኛ አስተማማኝነት

● በደንብ የተነደፉ ለህትመት ዝግጁ የሆኑ አሃዞች

● ከፍተኛ ችሎታ ያለው የባዮኢንፎርማቲክስ ቡድን የተለያዩ ግላዊ ትንተና ፍላጎቶችን ያሟላል።

● አጭር የማዞሪያ ጊዜ እና በመተንተን ከፍተኛ ትክክለኛነት

● ከ90 በላይ የተሳካላቸው ጉዳዮች ከ900 በላይ የተከማቸ ውጤት ያለው የተትረፈረፈ ልምድ

የአገልግሎት ዝርዝሮች

የተገመተው የማዞሪያ ጊዜ

የዝርያዎች ብዛት

ይተነትናል።

30 የስራ ቀናት

6 - 12

የጂን ቤተሰብ ስብስብ

የጂን ቤተሰብ መስፋፋት እና መኮማተር

የፋይሎኔቲክ ዛፍ ግንባታ

የልዩነት ጊዜ ግምት(የቅሪተ አካል ልኬት ያስፈልጋል)

LTR ማስገቢያ ጊዜ (ለእፅዋት)

ሙሉ ጂኖም ብዜት (ለእፅዋት)

የተመረጠ ግፊት

የሲንታይን ትንተና

ባዮኢንፎርማቲክስ ትንታኔዎች

● የጂን ቤተሰብ

● ፊሎሎጂኔቲክስ

● የመለያየት ጊዜ

● የተመረጠ ግፊት

● የሲንታይን ትንተና

流程图 ተነጻጻሪ ጂኖሚክስ

ናሙና መስፈርቶች እና ማድረስ

የናሙና መስፈርቶች፡

ቲሹ ወይም ዲ ኤን ኤ ለጂኖም ቅደም ተከተል እና ስብስብ

ለቲሹ

ዝርያዎች

ቲሹ

የዳሰሳ ጥናት

PacBio CCS

እንስሳ

Visceral ቲሹ

0.5 ~ 1 ግ

≥ 3.5 ግ

የጡንቻ ሕዋስ

≥ 5.0 ግ

≥ 5.0 ሚሊ

የአጥቢ እንስሳት ደም

0.5 ሚሊ ሊትር

የዶሮ እርባታ / የዓሳ ደም

ተክል

ትኩስ ቅጠል

1 ~ 2 ግ

≥ 5.0 ግ

 

ፔታል/ግንድ

1 ~ 2 ግ

≥ 10.0 ግ

 

ሥር/ ዘር

1 ~ 2 ግ

≥ 20.0 ግ

ሕዋሳት

የዳበረ ሕዋስ

-

≥ 1 x 108

ውሂብ

የጂኖም ቅደም ተከተል ፋይሎች (.ፋስታ) እና የማብራሪያ ፋይሎች (.gff3) በቅርብ ተዛማጅ ዝርያዎች

የአገልግሎት ሥራ ፍሰት

ናሙና QC

የሙከራ ንድፍ

ናሙና መላኪያ

ናሙና መላኪያ

የቤተ መፃህፍት ዝግጅት

የቤተ መፃህፍት ግንባታ

ቅደም ተከተል

ቅደም ተከተል

የውሂብ ትንተና

የውሂብ ትንተና

ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች

ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች


  • ቀዳሚ፡
  • ቀጣይ፡-

  • *እዚህ የሚታዩት የማሳያ ውጤቶች ሁሉም በባዮማርከር ቴክኖሎጂዎች የታተሙ ጂኖም ናቸው።

    1.LTR የማስገባት ጊዜ ግምት፡- ስዕሉ ከሌሎች ዝርያዎች ጋር ሲነጻጸር በ LTR-RTs ውስጥ ልዩ የሆነ የቢሞዳል ስርጭት በWeining Rye ጂኖም ውስጥ ያሳያል።በጣም የቅርብ ጊዜ ከፍተኛው ከ 0.5 ሚሊዮን ዓመታት በፊት ታየ።

    3LTR-የማስገቢያ-ጊዜ-ግምት-በዊኒንግ-ራይ

    ሊ ጓንግ እና ሌሎች.የተፈጥሮ ጄኔቲክስ, 2021

     

     

    2. ቻዮቴ (ሴቺየም ኢዱሌ) ላይ ፊሎጅኒ እና የጂን ቤተሰብ ትንታኔ፡- ቻዮት እና ሌሎች 13 ተዛማጅ ዝርያዎችን በጂን ቤተሰብ ውስጥ በመተንተን ቻዮት ከእባቡ ጎደር (Trichosanthes anguina) ጋር በጣም የተቆራኘ ሆኖ ተገኝቷል።በ27-45 ማያ አካባቢ ከእባቡ ጓድ የተገኘ ቻዮት እና ሙሉ የጂኖም ብዜት(WGD) በ25±4 ማያ ውስጥ በቻዮት ታይቷል፣ይህም በcucuibitaceae ሶስተኛው የWGD ክስተት ነው።

    4ፊሎጄኔቲክ-የቻዮት ዛፍ

    ፉ ኤ እና ሌሎችየሆርቲካልቸር ምርምር, 2021

     

     

    3.Synteny ትንተና: ፍሬ ልማት ውስጥ phytohormones ጋር የተያያዙ አንዳንድ ጂኖች chayote, እባብ ጎርድ እና ስኳሽ ውስጥ ተገኝተዋል.በቻይዮት እና በስኩዊድ መካከል ያለው ዝምድና በ chayote እና በእባብ ጎመን መካከል ካለው ትንሽ ከፍ ያለ ነው።

    4ፊሎጄኔቲክ-የቻዮት ዛፍ

    ፉ ኤ እና ሌሎችየሆርቲካልቸር ምርምር, 2021

     

     

    4.Gene ቤተሰብ ትንተና፡- የ KEGG የጂን ቤተሰብ መስፋፋት እና መኮማተር በG.thurberi እና G.davidsonii ጂኖም ውስጥ የስቴሮይድ ባዮሲንተሲስ እና ብራሲኖስቴሮይድ ባዮሲንተሲስ ተዛማጅ ጂኖች መስፋፋታቸውን ያሳያል።

    4ፊሎጄኔቲክ-የቻዮት ዛፍ

    ያንግ ዚ እና ሌሎች፣ቢኤምሲ ባዮሎጂ, 2021

     

     

    5.ሙሉ የጂኖም ብዜት ትንተና፡- 4DTV እና Ks ስርጭት ትንተና ሙሉ የጂኖም ብዜት ክስተት አሳይቷል።የተባዛ ክስተቶች ታይተዋል።የልዩነት ክውነቶች የታዩት የኢንተርስፔይሲዎች ጫፎች።ትንታኔው እንደሚያመለክተው ከሌሎቹ ሦስት የቅርብ ተዛማጅነት ያላቸው ዝርያዎች ጋር ሲነጻጸር፣ O. europaea በቅርቡ ትልቅ የጂን ብዜት ውስጥ እንደገባ ነው።

    4ፊሎጄኔቲክ-የቻዮት ዛፍ

    ራኦ ጂ እና ሌሎችየሆርቲካልቸር ምርምር, 2021

    BMK መያዣ

    ሮዝ ያለ ፕሪክል፡- ከእርጥበት መላመድ ጋር የተገናኘ የጂኖሚክ ግንዛቤዎች

    የታተመ ብሔራዊ ሳይንስ ግምገማ, 2021

    የቅደም ተከተል ስልት፡

    ' ባሴእሾህ የሌለው(አር.ዊቹራይናን) ጂኖም;
    በግምት.93 X PacBio + በግምት።90 X ናኖፖር + 267 X ኢሉሚና

    ቁልፍ ውጤቶች

    1.ከፍተኛ ጥራት ያለው R.wichuraiana ጂኖም የተገነባው ለረጅም ጊዜ የተነበበ ተከታታይ ቴክኒኮችን በመጠቀም ሲሆን ይህም 530.07 ሜጋ ባይት (የተገመተው የጂኖም መጠን በግምት 525.9 ሜጋ ባይት በወራጅ ሳይቶሜትሪ እና 525.5 በጂኖም ዳሰሳ ነበር; Heterozygosity 1.03%).BUSCO ግምት 93.9 በመቶ ነበር።ከ "አሮጌው ብሉሽ" (haploOB) ጋር በማነፃፀር, የዚህ ጂኖም ጥራት እና ሙሉነት በመነሻ ነጠላ-ቤዝ ትክክለኛነት እና LTR የመገጣጠሚያ መረጃ ጠቋሚ (LAI=20.03) ተረጋግጧል.R.wichuraiana ጂኖም 32,674 የፕሮቲን ኮድ ጂኖች ይዟል።

    2.Multi-omics መገጣጠሚያ ትንተና፣ ንፅፅር ጂኖሚክስ፣ ትራንስክሪፕቶሚክስ፣ QTL የጄኔቲክ ህዝብ ትንታኔን ያካተተ፣ በ R. wichuraiana እና Rosa chinensis መካከል ያለውን ወሳኝ ልዩነት አሳይቷል።እንዲሁም፣ በQTL ውስጥ ያሉ ተዛማጅ ጂኖች አገላለጽ ከግንድ ፕሪክል ጥለት ጋር የተያያዘ ሊሆን ይችላል።

    7KEGG-በጂን-ላይ-ቤተሰብ-ማስፋፋት-እና-ኮንትራት

    በ Basye's Thornless እና Rosa chinensis መካከል ያለው የንፅፅር ጂኖሚክስ ሲንተኒ ትንተና፣ የጂን ቤተሰብ ክላስተር፣ የማስፋፊያ እና የመቀነስ ትንተናን ጨምሮ በጽጌረዳዎች ውስጥ ካሉት ወሳኝ ባህሪያት ጋር የተያያዙ ብዙ ልዩነቶችን አሳይቷል።በNAC እና FAR1/FRS የጂን ቤተሰብ ውስጥ ያለው ልዩ መስፋፋት ከጥቁር ቦታ መቋቋም ጋር የተያያዘ ሊሆን ይችላል።

    81 ንጽጽር-ጂኖሚክስ-ትንታኔ-በBT-እና-OB መካከል 82 ንጽጽር-ጂኖሚክስ-ትንታኔ-በBT-እና-OB መካከል 83 ንጽጽር-ጂኖሚክስ-ትንታኔ-በBT-እና-OB መካከል

    በ BT እና haploOB ጂኖም መካከል ያለው የንፅፅር ጂኖሚክስ ትንተና።

    ማጣቀሻ

    Zhong, M., እና ሌሎች."ከእርጥበት መላመድ ጋር የተገናኘ ሮዝ ያለ ፕሪክል: የጂኖሚክ ግንዛቤዎች"ብሔራዊ ሳይንስ ግምገማ, 2021;, nwab092.

    ጥቅስ ያግኙ

    መልእክትህን እዚህ ጻፍ እና ላኩልን።

    መልእክትህን ላክልን፡