ምርቶች

የጅምላ ሴግሬጋን ትንታኔ

የጅምላ ሴግሬጋንት ትንተና (BSA) የፍኖታይፕ ተያያዥ የጄኔቲክ ማርከሮችን በፍጥነት ለመለየት የሚሰራ ዘዴ ነው።የቢኤስኤ ዋና የስራ ሂደት እጅግ በጣም ተቃራኒ ፊኖታይፕ ያላቸውን ሁለት ቡድኖች መምረጥ፣ የሁሉንም ግለሰቦች ዲኤንኤ በማዋሃድ ሁለት የዲ ኤን ኤ ይመሰርታል፣ ይህም በሁለት ገንዳዎች መካከል ያለውን ልዩነት የሚለይ ቅደም ተከተሎችን ይለያል።ይህ ዘዴ በእጽዋት/በእንስሳት ጂኖም ውስጥ በታለሙ ጂኖች በጥብቅ የተቆራኙትን የዘረመል ምልክቶችን ለመለየት በሰፊው ጥቅም ላይ ውሏል።

አግኙን

የአገልግሎት ዝርዝሮች

የማሳያ ውጤቶች

የጉዳይ ጥናት

የአገልግሎት ጥቅሞች

ታካጊ እና ሌሎች፣ የዕፅዋት ጆርናል፣ 2013

● ትክክለኛ የትርጉም ሥራ፡- ከ30+30 እስከ 200+200 ግለሰቦች ጋር ብዙዎችን በማደባለቅ የበስተጀርባ ድምጽን ለመቀነስ፤ተመሳሳይ ያልሆኑ ሚውታታንት-ተኮር የእጩ ክልል ትንበያ።

● አጠቃላይ ትንታኔ፡- ጥልቅ እጩ የጂን ተግባር ማብራሪያ፣ NR፣ SwissProt፣ GO፣ KEGG፣ COG፣ KOG ወዘተ ጨምሮ።

● ፈጣን የማዞሪያ ጊዜ፡ ፈጣን የጂን አካባቢ በ45 የስራ ቀናት ውስጥ።

● ሰፊ ልምድ፡ BMK በሺህዎች የሚቆጠሩ ባህሪያትን ወደ አካባቢያዊነት እንዲቀይር አበርክቷል፣ እንደ ሰብል፣ የውሃ ውስጥ ምርቶች፣ ደን፣ አበባ፣ ፍራፍሬ፣ ወዘተ ያሉ የተለያዩ ዝርያዎችን ይሸፍናል።

የአገልግሎት ዝርዝሮች

የህዝብ ብዛት፡
የወላጆችን ዘር ከተቃራኒ ፋኖታይፕ ጋር መለየት።
ለምሳሌ F2 ዘር፣ የኋላ መሻገር (BC)፣ ዳግም የተዋሃደ የተዳቀለ መስመር (አርአይኤል)

ድብልቅ ገንዳ
ለጥራት ባህሪያት፡ ከ30 እስከ 50 ግለሰቦች (ቢያንስ 20)/ጅምላ
ለቁጥራዊ ትሬቲስ፡ ከ5% እስከ 10% ከፍተኛ የሆኑ በጠቅላላው ህዝብ ውስጥ በጣም ጽንፈኛ ፍኖታይፕ ያላቸው ግለሰቦች (ቢያንስ 30+30)።

የሚመከር የቅደም ተከተል ጥልቀት
ቢያንስ 20X/ወላጅ እና 1X/ዘር ግለሰብ (ለምሳሌ 30+30 ግለሰብ ያለው የዘር ማደባለቅ ገንዳ፣የቅደም ተከተል ጥልቀት በጅምላ 30X ይሆናል)

ባዮኢንፎርማቲክስ ትንታኔዎች

● ሙሉ ጂኖም የሚከተል

● የውሂብ ሂደት

● SNP/Indel ጥሪ

● የእጩ ክልል ማጣሪያ

● የእጩ ጂን ተግባር ማብራሪያ

ናሙና መስፈርቶች እና ማድረስ

የናሙና መስፈርቶች፡

ኑክሊዮታይዶች;

የ gDNA ናሙና	የቲሹ ናሙና
ትኩረት: ≥30 ng/μl	ተክሎች: 1-2 ግ
መጠን፡ ≥2 μg (ጥራዝ ≥15 μl)	እንስሳት: 0.5-1 ግ
ንጽህና፡ OD260/280= 1.6-2.5	ሙሉ ደም: 1.5 ሚሊ

የአገልግሎት ሥራ ፍሰት

የሙከራ ንድፍ

ናሙና መላኪያ

አር ኤን ኤ ማውጣት

የቤተ መፃህፍት ግንባታ

ቅደም ተከተል

የውሂብ ትንተና

ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች

ቀዳሚ፡ ንፅፅር ጂኖሚክስ

ቀጣይ፡- የዝግመተ ለውጥ ጀነቲክስ

የእጩ ክልልን ለመለየት በ Euclidean Distance (ED) ላይ 1.የማህበር ትንተና መሰረት.በሚከተለው ምስል

X-ዘንግ: የክሮሞሶም ቁጥር;እያንዳንዱ ነጥብ የ SNP ኤዲ እሴትን ይወክላል።ጥቁሩ መስመር ከተገጠመ ED እሴት ጋር ይዛመዳል።ከፍ ያለ የ ED እሴት በጣቢያው እና በፍኖታይፕ መካከል የበለጠ ጉልህ የሆነ ግንኙነትን ያሳያል።ቀይ ሰረዝ መስመር ጉልህ የሆነ ትስስርን ይወክላል።

mRNA-FLNC-የተነበበ-ርዝመት-ስርጭት

2.Association ትንተና የተመሠረተ ምንም SNP-ኢንዴክስ

X-ዘንግ: የክሮሞሶም ቁጥር;እያንዳንዱ ነጥብ የSNP-ኢንዴክስ እሴትን ይወክላል።ጥቁሩ መስመር የተገጠመ SNP-ኢንዴክስ እሴትን ያመለክታል።ትልቅ ዋጋ ያለው, ማህበሩ የበለጠ ጉልህ ነው.

mRNA-የተሟላ-ORF-ርዝመት-ስርጭት

BMK መያዣ

ዋናው-ውጤት አሃዛዊ ባህሪ Fnl7.1 ዘግይቶ ፅንሥ የበዛ ፕሮቲን በኪያር ውስጥ ካለው የፍራፍሬ አንገት ርዝመት ጋር የተቆራኘ ያሳያል።

የታተመ የእፅዋት ባዮቴክኖሎጂ ጆርናል, 2020

የቅደም ተከተል ስልት፡

ወላጆች (Jin5-508፣ YN)፡ ሙሉ ጂኖም ለ 34× እና 20×።

የዲኤንኤ ገንዳዎች (50 ረጅም አንገት እና 50 አጭር አንገት)፡ ለ61× እና 52× ቅደም ተከተል

ቁልፍ ውጤቶች

በዚህ ጥናት ውስጥ፣ የህዝብ ብዛት (F2 እና F2፡3) የሚለየው ረጅም አንገት የኩሽ መስመር Jin5-508 እና አጭር አንገት YN በማቋረጥ ነው።ሁለት የዲኤንኤ ገንዳዎች የተገነቡት በ50 ጽንፍ ረዥም አንገት እና 50 ጽንፈኛ አንገት ባላቸው ግለሰቦች ነው።ከፍተኛ ውጤት QTL በBSA ትንተና እና በባህላዊ QTL ካርታ በ Chr07 ተለይቷል።የእጩው ክልል በጥሩ ካርታ፣ በጂን አገላለጽ መጠን እና ትራንስጂኒክ ሙከራዎች የበለጠ ጠባብ ሆኗል፣ ይህም የአንገት ርዝመትን ለመቆጣጠር ቁልፍ ጂን አሳይቷል፣ CsFnl7.1።በተጨማሪም፣ በ CsFnl7.1 አራማጅ ክልል ውስጥ ያለው ፖሊሞርፊዝም ከተዛማጅ አገላለጽ ጋር የተያያዘ ሆኖ ተገኝቷል።ተጨማሪ የፊሎጄኔቲክ ትንታኔ Fnl7.1 ሎከስ ከህንድ የመነጨ ሊሆን እንደሚችል ጠቁሟል።