ምርቶች

16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS

16S/18S/ITS የአምፕሊኮን ቅደም ተከተል ዓላማው በጣም የተነጋገሩትን እና ተለዋዋጭ ክፍሎችን የያዙ PCR የቤት አያያዝ የጄኔቲክ ማርከሮችን በመመርመር በጥቃቅን ማህበረሰብ ውስጥ የዝርያ ፣የታክሶኖሚ እና የዝርያ ብዛትን ለማሳየት ነው።የእነዚህ ፍፁም የሞለኪውላር የጣት አሻራ በ Woeses et al፣(1977) ማስተዋወቅ ከገለልተኝነት ነፃ የሆነ የማይክሮባዮም መገለጫን ያበረታታል።የ16S (ባክቴሪያዎች)፣ 18S (ፈንጋይ) እና Internal transcribed spacer(አይቲኤስ፣ ፈንገስ) ቅደም ተከተላቸው ሁለቱንም በብዛት የሚገኙ ዝርያዎችን እንዲሁም ብርቅዬ እና የማይታወቁ ዝርያዎችን ለመለየት ያስችላል።ይህ ቴክኖሎጂ በተለያዩ አከባቢዎች ማለትም በሰው አፍ፣ አንጀት፣ ሰገራ፣ ወዘተ ያሉ ልዩ ልዩ ተህዋሲያን ስብጥርን በመለየት በስፋት የተተገበረ እና ዋና መሳሪያ እየሆነ መጥቷል።

መድረክ፡ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ

አግኙን

የአገልግሎት ዝርዝሮች

የማሳያ ውጤቶች

የጉዳይ ጥናት

የአገልግሎት ጥቅሞች

● በአከባቢ ናሙናዎች ውስጥ የማይክሮባላዊ ስብጥርን ከማግለል ነፃ እና ፈጣን መለየት

● በአካባቢያዊ ናሙናዎች ውስጥ ዝቅተኛ የተትረፈረፈ ክፍሎች ውስጥ ከፍተኛ ጥራት

● የቅርብ ጊዜ QIIME2 ፍሰትን በመረጃ ቋት ፣ በማብራራት ፣ OTU/ASV አንፃር ከተለያዩ ትንታኔዎች ጋር።

● ከፍተኛ-ትክክለኝነት

● ለተለያዩ የማይክሮባዮሎጂ ማህበረሰብ ጥናቶች ተፈጻሚ ይሆናል።

● BMK በአመት ከ100,000 በላይ ናሙናዎች፣አፈርን፣ውሃን፣ ጋዝን፣ ዝቃጭን፣ ሰገራን፣ አንጀትን፣ ቆዳን፣ የመፍላት መረቅን፣ ነፍሳትን፣ እፅዋትን፣ ወዘተ በመሸፈን ሰፊ ልምድ አለው።

● BMKCloud 45 ግላዊነት የተላበሱ የመመርመሪያ መሳሪያዎችን የያዘ የውሂብ ትርጉም አመቻችቷል።

የአገልግሎት ዝርዝሮች

ቅደም ተከተልመድረክ	ቤተ መፃህፍት	የሚመከር የውሂብ ምርት	የተገመተው የማዞሪያ ጊዜ
ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ	ፒኢ250	50ኪ/100ኪ/300ኪ መለያዎች	30 ቀናት

ባዮኢንፎርማቲክስ ትንታኔዎች

● የጥሬ መረጃ ጥራት ቁጥጥር

● የኦቲዩ ስብስብ/ድምፅ ማጥፋት(ASV)

● የ OTU ማብራሪያ

● የአልፋ ልዩነት

● የቤታ ልዩነት

● የቡድን ትንተና

● በሙከራ ሁኔታዎች ላይ የማህበሩ ትንተና

● የተግባር ጂን ትንበያ

ናሙና መስፈርቶች እና ማድረስ

የናሙና መስፈርቶች፡

ለየዲኤንኤ ውህዶች:

የናሙና ዓይነት	መጠን	ትኩረት መስጠት	ንጽህና
የዲኤንኤ ውህዶች	： 30 ንግ	1 ng/μl	OD260/280= 1.6-2.5

ለአካባቢያዊ ናሙናዎች፡-

የናሙና ዓይነት	የሚመከር የናሙና አሰራር
አፈር	የናሙና መጠን: በግምት.5 ግ;የተረፈውን የደረቀ ንጥረ ነገር ከምድር ላይ ማስወገድ ያስፈልጋል;ትላልቅ ቁርጥራጮችን መፍጨት እና በ 2 ሚሜ ማጣሪያ ውስጥ ማለፍ;የ Aliquot ናሙናዎች በማይጸዳ EP-tube ወይም cyrotube ውስጥ ለማስያዝ።
ሰገራ	የናሙና መጠን: በግምት.5 ግ;ለቦታ ማስያዝ በማይጸዳ EP-tube ወይም cryotube ውስጥ ናሙናዎችን ይሰብስቡ እና ይልቀቁ።
የአንጀት ይዘት	ናሙናዎች በ aseptic ሁኔታ ውስጥ መደረግ አለባቸው.የተሰበሰበውን ቲሹ በፒቢኤስ ያጠቡ;ፒቢኤስን ሴንትሪፉግ ያድርጉ እና በ EP-tubes ውስጥ ያለውን ተንሳፋፊ ይሰብስቡ።
ዝቃጭ	የናሙና መጠን: በግምት.5 ግ;ለቦታ ማስያዝ በማይጸዳ EP-tube ወይም cryotube ውስጥ ዝቃጭ ናሙና ይሰብስቡ እና ይላኩ።
የውሃ አካል	እንደ የቧንቧ ውሃ፣ የጉድጓድ ውሃ፣ ወዘተ የመሳሰሉ ውስን መጠን ያለው ረቂቅ ተሕዋስያን ላለው ናሙና ቢያንስ 1 ሊትር ውሃ ይሰብስቡ እና በ 0.22 μm ማጣሪያ ውስጥ በማለፍ በገለባው ላይ ረቂቅ ተሕዋስያንን ለማበልጸግ።ሽፋኑን በማይጸዳ ቱቦ ውስጥ ያከማቹ።
ቆዳ	የቆዳውን ገጽታ በማይጸዳ ጥጥ ወይም በቀዶ ጥገና ምላጭ በጥንቃቄ ይከርክሙት እና በማይጸዳ ቱቦ ውስጥ ያስቀምጡት።

የሚመከር ናሙና ማድረስ

ናሙናዎቹን በፈሳሽ ናይትሮጅን ውስጥ ለ 3-4 ሰአታት ያቀዘቅዙ እና በፈሳሽ ናይትሮጅን ወይም -80 ዲግሪ ለረጅም ጊዜ በተያዘ ቦታ ውስጥ ያከማቹ።ከደረቅ በረዶ ጋር ናሙና መላክ ያስፈልጋል.

የአገልግሎት ሥራ ፍሰት

ናሙና መላኪያ

የቤተ መፃህፍት ግንባታ

ቅደም ተከተል

የውሂብ ትንተና

ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች

ቀዳሚ፡ የባክቴሪያ እና የፈንገስ ሙሉ ጂኖም ዳግም ቅደም ተከተል

ቀጣይ፡- 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio

1.Species ስርጭት

2.የሙቀት ካርታ፡የዝርያ ሀብት ስብስብ

3.Rare አንጃ ጥምዝ

4.NMDS ትንተና

5.Lefse ትንተና

BMK መያዣ

ዓይነት 2 የስኳር በሽታ ያለባቸው እና የሌላቸው ውፍረት ያላቸው ሰዎች የተለያዩ የአንጀት ረቂቅ ተሕዋስያን የመሥራት አቅም እና ስብጥር ያሳያሉ።

የታተመየሕዋስ አስተናጋጅ እና ማይክሮብ፣ 2019

የቅደም ተከተል ስልት፡

ዘንበል ያለ የስኳር በሽታ (n=633);ወፍራም ያልሆነ የስኳር በሽታ (n=494);ውፍረት-አይነት 2 የስኳር በሽታ (n=153);
የዒላማ ክልል፡ 16S rDNA V1-V2
መድረክ፡ ኢሉሚና ሚሴቅ (NGS ላይ የተመሰረተ የአምፕሊኮን ቅደም ተከተል)
የዲኤንኤ ውህዶች ንዑስ ክፍል በኢሉሚና ሂሴቅ ላይ ለሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል ተዳርገዋል።

ቁልፍ ውጤቶች

የእነዚህ የሜታቦሊክ በሽታዎች ጥቃቅን መገለጫዎች በተሳካ ሁኔታ ተለይተዋል.
በ 16S ቅደም ተከተል የመነጩ ጥቃቅን ባህሪያትን በማነፃፀር ከመጠን በላይ መወፈር ከጥቃቅን ስብጥር ለውጦች, ከግለሰባዊ ባህሪያት, በተለይም በአክከርማንሲያ, ፋካሊባክቲሪየም, ኦስሲሊባፕተር, አሊስታይፕስ, ወዘተ ላይ ከፍተኛ ቅናሽ ተገኝቷል. በተጨማሪም T2D በ Escherichia/shigella መጨመር ጋር ተያይዞ ተገኝቷል. .

ማጣቀሻ

Thingholm, LB, እና ሌሎች.ዓይነት 2 የስኳር በሽታ ያለባቸው እና የሌላቸው ከመጠን በላይ ወፍራም የሆኑ ሰዎች የተለያዩ የአንጀት ማይክሮቢያዊ ተግባራዊ አቅም እና ቅንብር ያሳያሉ።የሕዋስ አስተናጋጅ እና ማይክሮቦች26.2 (2019).