-
Vollengte mRNA-volgordebepaling-Nanopore
RNA-volgordebepaling was 'n waardevolle hulpmiddel vir omvattende transkriptomanalise.Tradisionele kortleesvolgorde het ongetwyfeld talle belangrike ontwikkelings hier bereik.Nietemin ondervind dit dikwels beperkings in vollengte isovorm-identifikasies, kwantifisering, PCR-vooroordeel.
Nanopore-volgordebepaling onderskei hom van ander volgordebepalingsplatforms deurdat die nukleotiede direk gelees word sonder DNS-sintese en genereer lang lees by tientalle kilobasisse.Dit bemagtig direkte uitlees wat vollengte transkripsies kruis en die uitdagings in isovormvlakstudies aanpak.
Platform:Nanopore PromethION
Biblioteek:cDNA-PKR
-
De novo Vollengte Transkriptoom-volgordebepaling -PacBio
De novovollengte transkriptoomvolgordebepaling, ook bekend asDe novoIso-Seq neem die voordele van PacBio-volgorder in leeslengte, wat opeenvolging van vollengte cDNA-molekules moontlik maak sonder enige onderbrekings.Dit vermy heeltemal enige foute wat in transkripsie-samestellingstappe gegenereer word en konstrueer unigeen-stelle met isovorm-vlak resolusie.Hierdie unigeen-stelle verskaf kragtige genetiese inligting as "verwysingsgenoom" op transkripsievlak.Daarbenewens, kombineer met die volgende generasie volgorde data, hierdie diens bemagtig 'n akkurate kwantifisering van isovorm-vlak uitdrukking.
Platform: PacBio Sequel IIBiblioteek: SMRT-klokbiblioteek -
Eukariotiese mRNA-volgordebepaling-Illumina
mRNA-volgordebepaling maak profilering moontlik van alle mRNA's wat uit selle getranskripsie is onder spesifieke toestande.Dit is 'n kragtige tegnologie om geenuitdrukkingprofiel, geenstrukture en molekulêre meganismes van sekere biologiese prosesse te openbaar.Tot op hede is mRNA-volgordebepaling wyd gebruik in fundamentele navorsing, kliniese diagnostiek, geneesmiddelontwikkeling, ens.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Nie-verwysingsgebaseerde mRNA-volgordebepaling-Illumina
mRNA-volgordebepaling gebruik volgende-generasie volgordebepalingstegniek (NGS) om die boodskapper-RNA(mRNA) van Eukariote vas te vang op spesifieke tydperk wat sommige spesiale funksies aktiveer.Die langste transkripsie wat gesplits is, is 'Unigene' genoem en gebruik as die verwysingsvolgorde vir daaropvolgende analise, wat 'n effektiewe manier is om die molekulêre meganisme en regulatoriese netwerk van die spesie sonder verwysing te bestudeer.
Na transkripsiedatasamestelling en unigene funksionele annotasie
(1)SNP-analise, SSR-analise, CDS-voorspelling en geenstruktuur sal vooraf gevorm word.
(2) Kwantifisering van unigene uitdrukking in elke monster sal uitgevoer word.
(3) Differensieel uitgedrukte unigenes tussen monsters (of groepe) sal ontdek word gebaseer op unigeen uitdrukking
(4) Groepering, funksionele annotasie en verrykingsanalise van differensieel uitgedrukte unigenene sal uitgevoer word
-
Lang nie-koderende volgorde-Illumina
Lang nie-koderende RNA's (lncRNA's) is 'n tipe RNA-molekules met 'n lengte van meer as 200 nt, wat gekenmerk word deur uiters lae koderingspotensiaal.LncRNA, as 'n sleutellid in nie-koderende RNA's, word hoofsaaklik in kern en plasma aangetref.Die ontwikkeling in volgordebepalingtegnologie en bioinformtika maak identifikasie van talle nuwe lncRNA's moontlik en assosieer dié met biologiese funksies.Akkumulatiewe bewyse dui daarop dat lncRNA wyd betrokke is by epigenetiese regulering, transkripsieregulering en post-transkripsieregulering.
-
Klein RNA-volgordebepaling-Illumina
Klein RNA verwys na 'n klas nie-koderende RNA-molekules wat gewoonlik minder as 200 nt lank is, insluitend mikro-RNA (miRNA), klein interferensie-RNA (siRNA) en piwi-interaksie-RNA (piRNA).
Mikro-RNA (miRNA) is 'n klas van endogene klein RNA met 'n lengte van ongeveer 20-24nt, wat 'n verskeidenheid belangrike regulerende rolle in selle speel.miRNA betrokke by baie lewensprosesse wat weefsel - spesifieke en stadium - spesifieke uitdrukking openbaar en hoogs bewaar in verskillende spesies.
-
circRNA-volgordebepaling-Illumina
Hele transkripsievolgordebepaling is ontwerp om alle tipes RNA-molekules te profileer, insluitend kodende (mRNA) en nie-koderende RNA's (insluitend lncRNA, circRNA en miRNA) wat op 'n sekere tyd deur spesifieke selle getranskribeer word.Hele transkriptoomvolgordebepaling, ook bekend as "totale RNA-volgordebepaling" het ten doel om omvattende regulatoriese netwerke op transkripsievlak te openbaar.Deur gebruik te maak van NGS-tegnologie, is volgordes van hele transkriptoomprodukte beskikbaar vir ceRNA-analise en gesamentlike RNA-analise, wat die eerste stap na funksionele karakterisering bied.Onthullende regulatoriese netwerk van circRNA-miRNA-mRNA-gebaseerde ceRNA.
-
Hele transkripsievolgordebepaling – Illumina
Hele transkripsievolgordebepaling is ontwerp om alle tipes RNA-molekules te profileer, insluitend kodende (mRNA) en nie-koderende RNA's (insluitend lncRNA, circRNA en miRNA) wat op 'n sekere tyd deur spesifieke selle getranskribeer word.Hele transkriptoomvolgordebepaling, ook bekend as "totale RNA-volgordebepaling" het ten doel om omvattende regulatoriese netwerke op transkripsievlak te openbaar.Deur gebruik te maak van NGS-tegnologie, is volgordes van hele transkriptoomprodukte beskikbaar vir ceRNA-analise en gesamentlike RNA-analise, wat die eerste stap na funksionele karakterisering bied.Onthullende regulatoriese netwerk van circRNA-miRNA-mRNA-gebaseerde ceRNA.
-
Prokariotiese RNA-volgordebepaling
Prokariotiese RNA-volgordebepaling gebruik volgende generasie volgordebepaling (NGS) om die teenwoordigheid en hoeveelheid RNA op 'n gegewe oomblik te openbaar deur die veranderende sellulêre transkriptoom te ontleed.Ons maatskappy se prokariotiese RNA-volgordebepaling is spesifiek gemik op prokariote met verwysingsgenome, wat jou voorsien van transkripsieprofiele, geenstruktuuranalise, ens. Dit is wyd toegepas op basiese wetenskaplike navorsing, geneesmiddelnavorsing en -ontwikkeling, en meer.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Metatranskriptoomvolgordebepaling
Metatranskriptoomvolgordebepaling identifiseer geenuitdrukking van mikrobes (beide eukariote en prokariote) binne natuurlike omgewings (dws grond, water, see, ontlasting en ingewande). Spesifiek, hierdie dienste stel jou in staat om volledige geenuitdrukking-profilering van komplekse mikrobiese gemeenskappe, taksonomiese analise te verkry. van spesies, funksionele verrykingsanalise van gene wat verskillend uitgedruk word, en meer.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
