Klein RNA-volgordebepaling-Illumina
Kenmerke
● Groottekeuse van RNA voor biblioteekvoorbereiding
● Bioinformatiese analise het gesentreer rondom miRNA-voorspelling en hul teikens
Diensvoordele
●Omvattende bioinformatika-analise:wat die identifikasie van beide bekende en nuwe miRNAs moontlik maak, identifikasie van miRNAs teikens en ooreenstemmende funksionele annotasie en verryking met veelvuldige databasisse (KEGG, GO)
●Streng kwaliteitbeheer: ons implementeer kernbeheerpunte oor alle stadiums, van monster- en biblioteekvoorbereiding tot volgordebepaling en bioinformatika.Hierdie noukeurige monitering verseker die lewering van konsekwent hoë kwaliteit resultate.
●Ondersteuning na verkope: Ons verbintenis strek verder as projekvoltooiing met 'n 3-maande na-verkope dienstydperk.Gedurende hierdie tyd bied ons projekopvolging, probleemoplossingshulp en V&A-sessies aan om enige navrae wat met die resultate verband hou, aan te spreek.
●Uitgebreide kundigheid: met 'n rekord van suksesvolle sluiting van meer as 100 sRNA-projekte wat meer as 100 spesies in verskeie navorsingsdomeine dek, bring ons span 'n magdom ervaring na elke projek.
Voorbeeldvereistes en aflewering
| Biblioteek | Platform | Aanbevole data | Data QC |
| Grootte gekies | Illumina SE50 | 10M-20M lees | Q30≥85% |
Voorbeeldvereistes:
Nukleotiede:
| Kons.(ng/μl) | Hoeveelheid (μg) | Reinheid | Integriteit |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Beperkte of geen proteïen- of DNA-kontaminasie word op gel gewys. | RIN≥6,5; 5.0≥28S/18S≥1.0; beperkte of geen basislyn hoogte nie |
● Plante:
Wortel, stingel of blomblaar: 450 mg
Blaar of Saad: 300 mg
Vrugte: 1,2 g
● Dier:
Hart of Ingewande: 450 mg
Ingewande of brein: 240 mg
Spier: 600 mg
Bene, hare of vel: 1,5 g
● Geledpotiges:
Insekte: 9g
Skaaldiere: 450 mg
● Volbloed: 2 buise
● Selle: 106 selle
● Serum en plasma:6 ml
Aanbevole voorbeeldaflewering
Houer:
2 ml sentrifugeerbuis (tinfoelie word nie aanbeveel nie)
Monsteretikettering: Groep+repliseer bv. A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
Versending:
1. Droë-ys: Monsters moet in sakke verpak en in droë-ys begrawe word.
2. RNA-stabiele buise: RNA-monsters kan in RNA-stabiliseringsbuis gedroog word (bv. RNAstable®) en in kamertemperatuur verskeep word.
Dienswerkvloei
Eksperiment ontwerp
Voorbeeld aflewering
RNA-ekstraksie
Biblioteek konstruksie
Opeenvolging
Data-analise
Na-verkope dienste
Bioinformatika
Identifikasie van miRNA: struktuur en diepte
Differensiële uitdrukking van miRNA – hiërargiese groepering
Funksionele annotasie van teiken van differensieel uitgedrukte miRNA's
Verken die navorsingsvorderings wat deur BMKGene se sRNA-volgordebepalingsdienste gefasiliteer word deur 'n saamgestelde versameling publikasies.
Chen, H. et al.(2023) 'Virale infeksies inhibeer saponienbiosintese en fotosintese in Panax notoginseng', Plant Physiology and Biochemistry, 203, p.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al.(2023) 'Die plant FYVE-domeinbevattende proteïen FREE1 assosieer met mikroverwerkerkomponente om miRNA-biogenese te onderdruk', berig EMBO, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) 'Die MicroRNA Ame-Bantam-3p beheer larwale poppie-ontwikkeling deur die veelvuldige epidermale groeifaktor-agtige domeine te teiken 8-gen (megf8) in die heuningby, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24(6), p. .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al.(2018) 'Geïntegreerde analise van MiRNA en gene wat met vleisgehalte geassosieer word, onthul dat Gga-MiR-140-5p binnespierse vetneerlegging in hoenders beïnvloed', Sellulêre Fisiologie en Biochemie, 46(6), pp. 2421–2433.doi: 10.1159/000489649.
