-
Chromatien-immunopresipitasie-volgordebepaling (ChIP-seq)
ChIP-Seq verskaf genoomwye profilering van DNA-teikens vir histoonmodifikasie, transkripsiefaktore en ander DNA-geassosieerde proteïene.Dit kombineer die selektiwiteit van chromatien-immuno-presipitasie (ChIP) om spesifieke proteïen-DNS-komplekse te herwin, met die krag van volgende-generasie-volgordebepaling (NGS) vir hoë-deurset-volgordebepaling van die herwonne DNA.Daarbenewens, omdat die proteïen-DNS-komplekse van lewende selle herwin word, kan bindingsplekke in verskillende seltipes en weefsels vergelyk word, of onder verskillende toestande.Toepassings wissel van transkripsieregulering tot ontwikkelingsweë tot siektemeganismes en verder.
Platform: Illumina NovaSeq-platform
-
Metagenomiese volgordebepaling -NGS
Metagenoom verwys na 'n versameling totale genetiese materiaal van 'n gemengde gemeenskap van organismes, soos omgewingsmetagenoom, menslike metagenoom, ens. Dit bevat genome van beide kweekbare en onkweekbare mikroörganismes.Metagenomiese volgordebepaling is 'n molekulêre instrument wat gebruik word om die gemengde genomiese materiale wat uit omgewingsmonsters onttrek word, te ontleed, wat gedetailleerde inligting verskaf oor spesiediversiteit en oorvloed, bevolkingstruktuur, filogenetiese verwantskap, funksionele gene en korrelasienetwerk met omgewingsfaktore.
Platform:Illumina NovaSeq-platform
-
Metagenomiese volgordebepaling-Nanopore
Metagenomics is 'n molekulêre instrument wat gebruik word om die gemengde genomiese materiale wat uit omgewingsmonsters onttrek word te ontleed, wat gedetailleerde inligting verskaf oor spesiediversiteit en oorvloed, bevolkingstruktuur, filogenetiese verwantskap, funksionele gene en korrelasienetwerk met omgewingsfaktore, ens. Nanopore-volgordebepalingsplatforms het onlangs bekend gestel. tot metagenomiese studies.Die uitstaande prestasie in leeslengte het grootliks stroomaf metagenomiese analise verbeter, veral metagenoomsamestelling.Met die voordeel van leeslengte, kan Nanopore-gebaseerde metagenomiese studie meer deurlopende samestelling bereik in vergelyking met haelgeweer-metagenomika.Dit is gepubliseer dat Nanopore-gebaseerde metagenomika suksesvol volledige en geslote bakteriese genome vanaf mikrobiome gegenereer het (Moss, EL, et. al,Natuur Biotech, 2020)
Platform:Nanopore PromethION P48
-
Heelgenoom bisulfietvolgordebepaling
DNA-metilering by die vyfde posisie in sitosien (5-mC) het 'n fundamentele invloed op geenuitdrukking en sellulêre aktiwiteit.Abnormale metileringspatrone is geassosieer met verskeie toestande en siektes, soos kanker.WGBS het die goue standaard geword vir die bestudering van genoomwye metilering by enkelbasisresolusie.
Platform: Illumina NovaSeq-platform
-
Toetsing vir transposase-toeganklike chromatien met hoë deursetvolgordebepaling (ATAC-volgorde)
ATAC-seq is 'n hoë-deurset-volgordebepalingsmetode vir ontleding van genoomwye chromatientoeganklikheid, wat belangrik is vir globale epigenetiese beheer van geenuitdrukking.Volgordebepalingsadapters word deur hiperaktiewe Tn5-transposase in oop chromatienstreke ingevoeg.Na PCR-amplifikasie word 'n volgordebepalingsbiblioteek saamgestel.Al die oop chromatienstreke kan verkry word onder 'n spesifieke ruimte-tyd toestand, nie net beperk tot die bindingsplekke van 'n transkripsiefaktor, of 'n sekere histoon-gemodifiseerde gebied nie.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Die subeenheid op 16S en 18S rRNA wat beide hoogs gekonserveerde en hiperveranderlike streke bevat, is 'n perfekte molekulêre vingerafdruk vir identifikasie van prokariotiese en eukariotiese organismes.Deur voordeel te trek uit volgordebepaling, kan hierdie amplikone geteiken word op grond van die bewaarde dele en die hiperveranderlike streke kan volledig gekarakteriseer word vir mikrobiese identifikasie wat bydra tot studies wat mikrobiese diversiteitsanalise, taksonomie, filogenie, ens dek. Enkel-molekule intyds (SMRT) ) volgordebepaling van PacBio-platform maak dit moontlik om hoogs akkurate langlesings te verkry, wat vollengte-amplikone (ongeveer 1,5 Kb) kan dek.Die breër siening van genetiese veld het die resolusie in spesie-annotasie in bakterieë of swamme gemeenskappe aansienlik verbeter.
Platform:PacBio Vervolg II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplikonvolgordebepaling het ten doel om filogenie, taksonomie en spesie-oorvloed in 'n mikrobiese gemeenskap te openbaar deur PCR-produkte van huishoudelike genetiese merkers te ondersoek wat beide hoogs gekonfronteerde en hiperveranderlike dele bevat.Die bekendstelling van hierdie perfekte molekulêre vingerafdrukke deur Woeses et al, (1977) bemagtig isolasie-vrye mikrobioom profilering.Volgordebepaling van 16S (bakterieë), 18S (swamme) en Interne getranskribeerde spasieerder (ITS, swamme) laat identifikasie van beide volop spesies sowel as skaars en ongeïdentifiseerde spesies toe.Hierdie tegnologie het 'n wyd toegepaste en belangrike hulpmiddel geword om differensiële mikrobiese samestelling in verskeie omgewings te identifiseer, soos menslike mond, ingewande, ontlasting, ens.
Platform:Illumina NovaSeq-platform
-
Hervolgordebepaling van die hele genoom van bakterieë en swamme
Hervolgordebepaling van bakterie- en swamheelgenoom is 'n kritieke hulpmiddel om die genome van bekende bakterieë en swamme te voltooi, asook om veelvuldige genome te vergelyk of om genome van nuwe organismes te karteer.Dit is van groot belang om hele genome van bakterieë en swamme te volgorde om akkurate verwysingsgenome te genereer, om mikrobiese identifikasie en ander vergelykende genoomstudies te doen.
Platform: Illumina NovaSeq-platform
-
PacBio-Vollengte 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing
Amplicon (16S/18S/ITS) platform is ontwikkel met jare se ondervinding in mikrobiese diversiteit projek analise, wat gestandaardiseerde basiese analise en persoonlike analise bevat: basiese analise dek die hoofstroom analise inhoud van huidige mikrobiese navorsing, die analise inhoud is ryk en omvattend, en ontledingsresultate word in die vorm van projekverslae aangebied;Die inhoud van gepersonaliseerde analise is uiteenlopend.Monsters kan gekies word en parameters kan buigsaam gestel word volgens die basiese ontledingsverslag en navorsingsdoel, om persoonlike vereistes te verwesenlik.Windows-bedryfstelsel, eenvoudig en vinnig.
-
PacBio-Vollengte-transkriptoom (nie-verwysing)
Deur Pacific Biosciences (PacBio) Isoform-volgorde-data as invoer te neem, is hierdie toepassing in staat om vollengte-transkripsievolgordes te identifiseer (sonder samestelling).Deur vollengte-sekwense teen verwysingsgenoom te karteer, kan transkripsies geoptimaliseer word deur bekende gene, transkripsies, koderingsstreke, ens. In hierdie geval kan meer akkurate identifikasie van mRNA-strukture, soos alternatiewe splyting, ens, verkry word.Gesamentlike analise met NGS-transkripsievolgorde-data maak meer omvattende annotasie en meer akkurate kwantifisering in uitdrukking op transkripsievlak moontlik, wat grootliks stroomafwaarts differensiële uitdrukking en funksionele analise bevoordeel.
-
Verminderde verteenwoordiging Bisulfiet-volgordebepaling (RRBS)
DNA-metileringsnavorsing was nog altyd 'n warm onderwerp in siektenavorsing, en is nou verwant aan geenuitdrukking en fenotipiese eienskappe.RRBS is 'n akkurate, doeltreffende en ekonomiese metode vir DNA-metileringsnavorsing.Verryking van promotor- en CpG-eilandstreke deur ensiematiese splitsing (Msp I), gekombineer met Bisulfiet-volgordebepaling, verskaf hoë-resolusie DNA-metileringsopsporing.
Platform: Illumina NovaSeq-platform
-
Prokariotiese mRNA-volgordebepaling
mRNA-volgordebepaling bemagtig die omvattende profilering van alle mRNA-transkripsies binne selle onder spesifieke toestande.Hierdie voorpunt-tegnologie dien as 'n kragtige instrument, wat ingewikkelde geenuitdrukkingprofiele, geenstrukture en molekulêre meganismes wat met diverse biologiese prosesse geassosieer word, onthul.MRNA-volgordebepaling, wat wyd aangeneem word in fundamentele navorsing, kliniese diagnostiek en geneesmiddelontwikkeling, bied insig in die ingewikkeldhede van sellulêre dinamika en genetiese regulering.Ons prokariotiese mRNA-monsterverwerking is aangepas vir prokariotiese transkriptome, wat rRNA-uitputting en rigtinggewende biblioteekvoorbereiding behels.
Platform: Illumina NovaSeq X
