-
Enkelkern-RNA-volgordebepaling
Die vooruitgang in enkelselvaslegging en individuele biblioteekkonstruksietegniek, kombineer met hoë-deursetvolgordebepaling, laat geenuitdrukkingstudies op sel-vir-sel basis toe.Dit maak 'n dieper en volledige stelselanalise op komplekse selpopulasies moontlik, waarin dit grootliks die maskering van hul heterogeniteit vermy deur die gemiddelde van alle selle te neem.
Sommige selle is egter nie geskik om in enkelselsuspensie gemaak te word nie, dus ander monstervoorbereidingsmetodes – kernonttrekking uit weefsels is nodig, dit wil sê, kern word direk uit weefsels of sel onttrek en in enkelkernsuspensie voorberei vir enkel- selvolgordebepaling.
BMK verskaf 10× Genomics ChromiumTM-gebaseerde enkelsel-RNA-volgordebepalingsdiens.Hierdie diens is wyd gebruik in studies oor siekteverwante studies, soos immuunseldifferensiasie, tumorheterogeniteit, weefselontwikkeling, ens.
Ruimtelike transkriptoomskyfie: 10× Genomika
Platform: Illumina NovaSeq-platform
-
Plant-/dier-heelgenoomvolgordebepaling
Heelgenoomhervolgordebepaling, ook bekend as WGS, maak die onthulling van beide algemene en seldsame mutasies op die hele genoom moontlik, insluitend enkelnukleotiedpolimorfisme (SNP), invoegingsuitwissing (InDel), struktuurvariasie (SV) en kopiegetalvariasie (CNV) ).SV's maak 'n groter deel van die variasiebasis uit as SNP's en het 'n groter impak op die genoom, wat 'n beduidende effek op lewende organismes het.Langlees hervolgorde maak voorsiening vir meer presiese identifikasie van groot fragmente en ingewikkelde variasies omdat lang lees dit baie makliker maak om chromosomale kruising oor ingewikkelde streke soos tandemherhalings, GC/AT-ryke streke en hiperveranderlike streke te maak.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Ruimtelike Transkriptoom
Ruimtelike transkriptomika staan aan die voorpunt van wetenskaplike innovasie, wat navorsers bemagtig om in ingewikkelde geenuitdrukkingspatrone binne weefsels te delf, terwyl hul ruimtelike konteks bewaar word.Te midde van verskeie platforms het BMKGene die BMKManu S1000 Ruimtelike Transcriptome Chip ontwikkel, wat spog met 'nverbeterde resolusievan 5µM, wat die subsellulêre reeks bereik, en in staat stelmulti-vlak resolusie instellings.Die S1000-skyfie, met ongeveer 2 miljoen kolle, gebruik mikroputte wat gelaag is met krale wat gelaai is met ruimtelike strepieskode-opvangprobes.'n cDNA-biblioteek, verryk met ruimtelike strepieskodes, word van die S1000-skyfie voorberei en daarna op die Illumina NovaSeq-platform gerangskik.Die kombinasie van ruimtelike strepieskode-monsters en UMI's verseker die akkuraatheid en spesifisiteit van die gegenereerde data.Die BMKManu S1000-skyfie se unieke eienskap lê in sy veelsydigheid, wat multi-vlak resolusie-instellings bied wat fyn ingestel kan word op verskillende weefsels en vlakke van detail.Hierdie aanpasbaarheid posisioneer die skyfie as 'n uitstekende keuse vir uiteenlopende ruimtelike transkriptomika-studies, wat presiese ruimtelike groepering met minimale geraas verseker.
Deur die BMKManu S1000-skyfie en ander ruimtelike transkriptomika-tegnologieë te gebruik, kan navorsers 'n beter begrip kry van die ruimtelike organisasie van selle en die komplekse molekulêre interaksies wat binne weefsels voorkom, wat waardevolle insigte verskaf in die meganismes onderliggend aan biologiese prosesse in 'n wye reeks velde, insluitend onkologie, neurowetenskap, ontwikkelingsbiologie, immunologie en botaniese studies.
Platform: BMKManu S1000-skyfie en Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Ruimtelike Transkriptoom
Ruimtelike transkriptomika is 'n voorpunt-tegnologie wat navorsers in staat stel om geenuitdrukkingspatrone binne weefsels te ondersoek, terwyl hul ruimtelike konteks bewaar word.Een kragtige platform in hierdie domein is 10x Genomics Visium tesame met Illumina-volgordebepaling.Die beginsel van 10X Visium lê op 'n gespesialiseerde skyfie met 'n aangewese vangarea waar weefselafdelings geplaas word.Hierdie vangarea bevat strepieskode kolle, wat elk ooreenstem met 'n unieke ruimtelike ligging binne die weefsel.Die vasgevang RNA-molekules van die weefsel word dan gemerk met unieke molekulêre identifiseerders (UMI's) tydens die omgekeerde transkripsieproses.Hierdie strepieskode kolle en UMI's maak presiese ruimtelike kartering en kwantifisering van geenuitdrukking by 'n enkelsel-resolusie moontlik.Die kombinasie van ruimtelike strepieskode-monsters en UMI's verseker die akkuraatheid en spesifisiteit van die gegenereerde data.Deur hierdie Ruimtelike Transkriptomika-tegnologie te gebruik, kan navorsers 'n dieper begrip kry van die ruimtelike organisasie van selle en die komplekse molekulêre interaksies wat binne weefsels voorkom, wat waardevolle insigte bied in die meganismes onderliggend aan biologiese prosesse in verskeie velde, insluitend onkologie, neurowetenskap, ontwikkelingsbiologie, immunologie , en botaniese studies.
Platform: 10X Genomics Visium en Illumina NovaSeq
-
Vollengte mRNA-volgordebepaling-Nanopore
Terwyl NGS-gebaseerde mRNA-volgordebepaling dien as 'n veelsydige hulpmiddel vir geenuitdrukkingskwantifisering, beperk die afhanklikheid daarvan op kort leeswerk die doeltreffendheid daarvan in komplekse transkriptomiese ontledings.Nanopore-volgordebepaling, aan die ander kant, gebruik langleestegnologie, wat die volgordebepaling van vollengte mRNA-transkripsies moontlik maak.Hierdie benadering fasiliteer 'n omvattende verkenning van alternatiewe splitsing, geenfusies, poli-adenilering en die kwantifisering van mRNA isovorme.
Nanopore-volgordebepaling maak staat op nanopore enkelmolekule intydse elektriese seine.Gelei deur motoriese proteïene, bind dubbelstring-DNS aan nanopore-proteïene wat in 'n biofilm ingebed is, en ontspan terwyl dit deur die nanopore-kanaal beweeg onder 'n spanningsverskil.Die kenmerkende elektriese seine wat deur verskillende basisse op die DNA-string gegenereer word, word intyds opgespoor en geklassifiseer, wat akkurate en deurlopende nukleotiedvolgorde fasiliteer.Hierdie innoverende benadering oorkom kortleesbeperkings en bied 'n dinamiese platform vir ingewikkelde genomiese analise, insluitend komplekse transkriptomiese studies.
Platform: Nanopore Promethion P48
-
Vollengte mRNA-volgordebepaling -PacBio
Terwyl NGS-gebaseerde mRNA-volgordebepaling 'n veelsydige hulpmiddel is om geenuitdrukking te kwantifiseer, beperk die afhanklikheid daarvan op kort lees die gebruik daarvan in komplekse transkriptomiese ontledings.PacBio-volgordebepaling (Iso-Seq), aan die ander kant, gebruik langleestegnologie, wat die volgordebepaling van vollengte mRNA-transkripsies moontlik maak.Hierdie benadering fasiliteer 'n omvattende verkenning van alternatiewe splitsing, geenfusies en poli-adenilering alhoewel dit nie die primêre keuse vir geenuitdrukkingskwantifisering is nie, as gevolg van die hoë hoeveelheid data wat benodig word.
PacBio-volgordebepalingtegnologie maak staat op enkel-molekule, intydse (SMRT) volgordebepaling, wat 'n duidelike voordeel bied in die vaslegging van vollengte mRNA-transkripsies.Hierdie innoverende benadering behels die gebruik van nul-modus golfleiers (ZMWs), mikrovervaardigde putte wat die intydse waarneming van DNA-polimerase-aktiwiteit tydens volgordebepaling moontlik maak.Binne hierdie ZMW's sintetiseer PacBio se DNA-polimerase 'n komplementêre string DNA, wat lang leeswerk genereer wat die hele mRNA-transkripsies strek.PacBio-werking in Circular Consensus-volgordebepaling (CCS)-modus verbeter akkuraatheid deur dieselfde molekule herhaaldelik in volgorde te bepaal.Die gegenereerde HiFi-lesings het 'n akkuraatheid vergelykbaar met NGS, wat verder bydra tot 'n omvattende en betroubare ontleding van komplekse transkriptomiese kenmerke.Platform: PacBio Sequel II
-
Eukariotiese mRNA-volgordebepaling-Illumina
mRNA-volgordebepaling bemagtig die omvattende profilering van alle mRNA-transkripsies binne selle onder spesifieke toestande.Hierdie voorpunt-tegnologie dien as 'n kragtige instrument, wat ingewikkelde geenuitdrukkingprofiele, geenstrukture en molekulêre meganismes wat met diverse biologiese prosesse geassosieer word, onthul.MRNA-volgordebepaling, wat wyd aangeneem word in fundamentele navorsing, kliniese diagnostiek en geneesmiddelontwikkeling, bied insig in die ingewikkeldhede van sellulêre dinamika en genetiese regulering.
Platform: Illumina NovaSeq X
-
Nie-verwysingsgebaseerde mRNA-volgordebepaling-Illumina
mRNA-volgordebepaling bemagtig die omvattende profilering van alle mRNA-transkripsies binne selle onder spesifieke toestande.Hierdie voorpunt-tegnologie dien as 'n kragtige instrument, wat ingewikkelde geenuitdrukkingprofiele, geenstrukture en molekulêre meganismes wat met diverse biologiese prosesse geassosieer word, onthul.MRNA-volgordebepaling, wat wyd aangeneem word in fundamentele navorsing, kliniese diagnostiek en geneesmiddelontwikkeling, bied insig in die ingewikkeldhede van sellulêre dinamika en genetiese regulering.
Platform: Illumina NovaSeq X
-
Lang nie-koderende volgorde-Illumina
Lang nie-koderende RNA's (lncRNA's) is RNA's langer as 200 nukleotiede wat 'n minimale koderingspotensiaal besit en deurslaggewende elemente binne nie-koderende RNA is.Gevind in die kern en sitoplasma, speel hierdie RNA's deurslaggewende rolle in epigenetiese, transkripsionele en post-transkripsionele regulering, wat hul belangrikheid in die vorming van sellulêre en molekulêre prosesse onderstreep.LncRNA-volgordebepaling is 'n kragtige instrument in seldifferensiasie, ontogenese en menslike siektes.
Platform: Illumina NovaSeq
-
Klein RNA-volgordebepaling-Illumina
Klein RNA (sRNA) molekules, tipies minder as 200 nukleotiede lank, sluit mikroRNA's (miRNA's), klein interfererende RNA's (siRNA's) en piwi-interaksie RNA's (piRNA's) in.Onder hierdie is miRNA's, ongeveer 20-24 nukleotiede lank, veral opmerklik vir hul deurslaggewende regulatoriese rolle in verskeie sellulêre prosesse.Met weefsel-spesifieke en stadium-spesifieke uitdrukkingspatrone, toon miRNAs hoë bewaring oor verskillende spesies.
Platform: Illumina NovaSeq
-
circRNA-volgordebepaling-Illumina
Sirkulêre RNA-volgordebepaling (circRNA-seq) is om sirkelvormige RNA's te profileer en te ontleed, 'n klas RNA-molekules wat geslote lusse vorm as gevolg van nie-kanoniese splitsingsgebeure, wat hierdie RNA van verhoogde stabiliteit voorsien.Terwyl daar getoon is dat sommige circRNA's as mikroRNA-sponse optree, mikroRNA's sekwestreer en hulle verhoed om hul teiken-mRNA's te reguleer, kan ander circRNA's met proteïene in wisselwerking tree, geenuitdrukking moduleer of 'n rol in sellulêre prosesse hê.circRNA uitdrukkingsanalise verskaf insigte in die regulatoriese rolle van hierdie molekules en hul betekenis in verskeie sellulêre prosesse, ontwikkelingstadia en siektetoestande, wat bydra tot 'n dieper begrip van die kompleksiteit van RNA-regulering in die konteks van geenuitdrukking.
-
Hele transkripsievolgordebepaling – Illumina
Heeltranskriptoomvolgordebepaling bied 'n omvattende benadering tot die profilering van diverse RNA-molekules, wat beide koderende (mRNA) en nie-koderende RNA's (lncRNA, circRNA en miRNA) insluit.Hierdie tegniek vang die volle transkripsie van spesifieke selle op 'n gegewe oomblik vas, wat 'n holistiese begrip van sellulêre prosesse moontlik maak.Ook bekend as "totale RNA-volgordebepaling," het dit ten doel om ingewikkelde regulatoriese netwerke op die transkripsievlak te onthul, wat in-diepte analise moontlik maak, soos mededingende endogene RNA (ceRNA) en gesamentlike RNA-analise.Dit is die eerste stap in die rigting van funksionele karakterisering, veral in die ontrafeling van die regulatoriese netwerke wat sirRNA-miRNA-mRNA-gebaseerde ceRNA-interaksies behels.
