Hoogtepunte
In hierdie twee uur lange webinar is dit vir ons 'n groot eer om ses kundiges in gewasgenomika-arena te genooi.Ons sprekers sal 'n in-diepte interpretasie gee van twee Rye genomiese studies, wat pas onlangs gepubliseer is opNatuur Genetika:
1. Chromosoomskaal genoomsamestelling verskaf insigte in rogbiologie, evolusie en agronomiese potensiaal
2. 'n Genoomsamestelling van hoë gehalte beklemtoon roggenomiese eienskappe en agronomies belangrike gene
Ons is ook bly om Senior R&D-wetenskaplike van Biomarker Technologies te hê om sy ervaring in de novo-genoomsamestelling te deel.
Agenda
09:00 CET
Verwelkoming
Zheng Hong-kun
Stigter en HUB Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
President, Skool vir Gevorderde Landbouwetenskappe Peking Universiteit
09:15 vm
Verbetering van rog-, korog- en koringverbetering deur gebruik te maak van hoëgehalte verwysingsgenoomvolgorde
In hierdie webinaar het prof. Wang vir ons 'n algehele opdatering gegee oor die huidige status van triticeae genomiese navorsing en die sukses en deurbrake van die twee uitstaande werke oor roggenoomstudies gedemonstreer, wat pas onlangs op Nature Genetics gepubliseer is en die hele navorsing bekendstel. groepe wat lei en bydra in die werke.
09:25 vm
Cereal genomics @ IPK Gatersleben
Graangrasse van Triticeae-stam was 'n belangrike voedselbron in gematigde streke, wat lank reeds as 'n brandpunt in gewasverbetering en teling beskou word.Onder alle gekweekte spesies is hierdie stam bekend vir hul uiters komplekse genomiese kenmerke, insluitend groot genoomgroottes, hoë inhoud van TE's, poliploïdie, ens. In hierdie sessie het prof. Nils Stein vir ons 'n algehele inleiding gegee oor IPK Gatersleben en huidige status van graan. genomiese navorsing@IPK Gatersleben.
09:35 vm
Chromosoomskaal genoomsamestelling verskaf insigte in rogbiologie, evolusie en agronomiese potensiaal
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz Instituut vir Plantgenetika en Gewasplannavorsing (IPK)Rog (Secale cereale L.) is 'n buitengewone klimaatbestande graangewas, wat op groot skaal gebruik word om verbeterde koringvariëteite te produseer deur middel van introgressiewe verbastering, en beskik oor die hele repertorium van gene wat nodig is om basterteling moontlik te maak.Rog is allogaam en eers onlangs makgemaak, wat aan gekweekte rog toegang gee tot 'n diverse en ontginbare wildegenepoel.Om rog se agronomiese potensiaal verder te verbeter, het ons 'n chromosoomskaal geannoteerde samestelling van die 7.9 Mbp roggenoom vervaardig, en die kwaliteit daarvan omvattend bekragtig deur 'n reeks molekulêre genetiese hulpbronne te gebruik.Ons demonstreer toepassings van hierdie hulpbron met 'n wye reeks ondersoeke.Ons bied bevindinge aan oor gekweekte rog se onvolledige genetiese isolasie van wilde familielede, meganismes van genoom strukturele evolusie, patogeen weerstand, lae temperatuur verdraagsaamheid, vrugbaarheid beheer stelsels vir baster teling, en die opbrengs voordele van rog-koring introgressies.
10:05 vm
’n Genoomsamestelling van hoë gehalte beklemtoon roggenomiese eienskappe en agronomies belangrike gene
Rog is 'n waardevolle voedsel- en voergewas, 'n belangrike genetiese hulpbron vir koring- en korogverbetering, en 'n onontbeerlike materiaal vir doeltreffende vergelykende genomika-studies in grasse.Hier het ons die genoom van Weining-rog, 'n elite Chinese rogvariëteit, bepaal.Die saamgestelde contigs (7.74 Gb) was verantwoordelik vir 98.47% van die geskatte genoomgrootte (7.86 Gb), met 93.67% van die contigs (7.25 Gb) wat aan sewe chromosome toegewys is.Herhalende elemente het 90,31% van die saamgestelde genoom uitgemaak.In vergelyking met voorheen opeenvolgende Triticeae-genome, het Daniela, Sumaya en Sumana retrotransposons sterk uitbreiding in rog getoon.Verdere ontledings van Weining-samestelling werp nuwe lig op genoomwye geenduplisering en hul impak op styselbiosintese-gene, fisiese organisasies van komplekse prolamien-lokusse, geenuitdrukkingskenmerke onderliggend aan vroeë opskrif-eienskap, en vermeende huishouding-geassosieerde chromosomale streke en lokusse in rog.Hierdie genoomvolgorde beloof om die genomika en teelstudies van rog en verwante graangewasse te versnel.
10:35 vm
Uitdagings, oplossings en toekoms vir genoom de novo-samestelling
Genoom van hoë gehalte is die basis van genomiese studie.Alhoewel die vinnige ontwikkeling in volgordebepaling en algoritme 'n baie eenvoudiger en doeltreffender genoomsamestelling bemagtig het, neem die vereistes in samestelling akkuraatheid en volledigheid ook toe met die verdieping van navorsingsdoelwitte.In hierdie praatjie sal ek die huidige gewilde tegnologieë in genoomsamestelling met verskeie suksesvolle gevalle bespreek en 'n blik op die toekomstige ontwikkeling neem.
Postyd: Jan-08-2022