MIKROBIAAL
Bakteriese verenigbaarheid en immobilisasie met biochar verbeterde tebukonasoolafbraak, grondmikrobioomsamestelling en -funksionering
Vollengte 16S amplikon volgordebepaling |PacBio HiFi |Alfa diversiteit |Beta diversiteit
In hierdie studie is vollengte 16S amplikon volgordebepaling deur PacBio en bioinformatiese analise verskaf deur Biomarker Technologies.
Hoogtepunte
Biochar geïmmobiliseerde tebukonasool-afbrekende bakterieë Alcaligenes faecalis WZ-2 is bestudeer op biodegradasie doeltreffendheid en invloede op tebukonasool besmette grond in vergelyking met vry afbrekende stam WZ-2.
1. Biochar-geïmmobiliseerde WZ-2 het 'n meer doeltreffende afbraak in tebukonasool getoon in vergelyking met vry WZ-2 deur die halfleeftyd van tebukonasool in grond van 18.7 dae tot 13.3 dae te verminder.
2. Biochar-geïmmobiliseerde WZ-2 was in staat om inheemse grond mikrobiese ensiemaktiwiteite te herstel, insluitend urease, dehidrogenase en invertase, ens.
3. Mikrobiese profiel in biochar-geïmmobiliseerde WZ-2 behandelde grond bepaal deur vollengte 16S volgordebepaling het sterk ondersteun dat hierdie stelsel grondgesondheid kan herstel deur bakteriese gemeenskapstruktuur onder tebukonasool kontaminasie te verbeter.
Eksperiment (volgordeverwant)
Groepering: CK: Natuurlike grond;T: Grond gespik met tebukonasool;S: Tebukonasool bevat grond met vrye stam WZ-2;BC: Tebukonasool bevat grond met biochar;BCS: Tebukonasool bevat grond met biochar geïmmobiliseerde WZ-2.
Monsterneming: Totale grond-DNA-ekstraksie geamplifiseer deur 16S rDNA-inleiders
27F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') en 1492R (5'-GGTTACCTTGTTACGA),repeterende volle lengte 16S rDNA
Volgorde-platform: PacBio RS II
Opeenvolgingstrategie: CCS HIFI lees
Data-analise:BMKCloudBioinformatiese platformvorming maak goudvis 'n uitstekende genetiese modelstelsel vir visfisiologie en -evolusie.
Resultaat
Grond mikrobiese gemeenskapstruktuur is bepaal deur 16S rDNA volgordebepaling.OTU rykdom en alfa diversiteit indeks, insluitend Chao1, Ace, Shannon en Simpson indekse is geëvalueer om die spesie diversiteit in elke stelsel te openbaar.Na 60 dae inkubasie het alle indekse soortgelyke neiging getoon, dws tebukonasool kon vermindering in spesierykheid en diversiteit in grond veroorsaak.Deur stam WZ-2 by te voeg, is grondbakterieë gemeenskap egter gedeeltelik herwin in terme van beide rykdom en diversiteit.Beperkte verskil is tussen BC, BCS en CK waargeneem, wat aandui dat biochar en biochar-geïmmobiliseerde WZ-2 grondbiologiese gesondheid effektief kan herstel.
Ongeweegde paargroepmetode met rekenkundige gemiddeldes (UPGMA) is in hierdie studie toegepas om beta-diversiteit onder groepe aan te toon.Soos getoon in die volgende figuur, het BC, BSC en CK meer soortgelyke patroon van mikrobiese samestelling gedeel in vergelyking met groep T en S, wat verder aangedui het dat die bekendstelling van biochar in tebukonasool-besmette grondbioremediëring grootliks die herstel van mikrobiese gemeenskap in die grond kan fasiliteer.
Figuur.UPGMA-groepering van bakteriese gemeenskap op filumvlak onder verskillende behandeling
Verwysing
Sun, Tong, et al."Bakteriese verenigbaarheid en immobilisasie met biochar het tebukonasoolafbraak, grondmikrobioomsamestelling en -funksionering verbeter."Tydskrif vir Gevaarlike Materiale398 (2020): 122941.
Nuus en hoogtepunte poog om die nuutste suksesvolle gevalle met Biomarker Technologies te deel, nuwe wetenskaplike prestasies vas te lê sowel as prominente tegnieke wat tydens die studie toegepas is.
Postyd: Jan-08-2022