-
Metagenomiese volgordebepaling (NGS)
Metagenoom verwys na 'n versameling totale genetiese materiaal van 'n gemengde gemeenskap van organismes, soos omgewingsmetagenoom, menslike metagenoom, ens. Dit bevat genome van beide kweekbare en onkweekbare mikroörganismes.Metagenomiese volgordebepaling is 'n molekulêre instrument wat gebruik word om die gemengde genomiese materiale wat uit omgewingsmonsters onttrek word, te ontleed, wat gedetailleerde inligting verskaf oor spesiediversiteit en oorvloed, bevolkingstruktuur, filogenetiese verwantskap, funksionele gene en korrelasienetwerk met omgewingsfaktore.
Platform:Illumina NovaSeq6000
-
Metagenomiese volgordebepaling-Nanopore
Metagenomics is 'n molekulêre instrument wat gebruik word om die gemengde genomiese materiale wat uit omgewingsmonsters onttrek word te ontleed, wat gedetailleerde inligting verskaf oor spesiediversiteit en oorvloed, bevolkingstruktuur, filogenetiese verwantskap, funksionele gene en korrelasienetwerk met omgewingsfaktore, ens. Nanopore-volgordebepalingsplatforms het onlangs bekend gestel. tot metagenomiese studies.Die uitstaande prestasie in leeslengte het grootliks stroomaf metagenomiese analise verbeter, veral metagenoomsamestelling.Met die voordeel van leeslengte, kan Nanopore-gebaseerde metagenomiese studie meer deurlopende samestelling bereik in vergelyking met haelgeweer-metagenomika.Dit is gepubliseer dat Nanopore-gebaseerde metagenomika suksesvol volledige en geslote bakteriese genome vanaf mikrobiome gegenereer het (Moss, EL, et. al,Natuur Biotegnologie, 2020)
Platform:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Die subeenheid op 16S en 18S rRNA wat beide hoogs gekonserveerde en hiperveranderlike streke bevat, is 'n perfekte molekulêre vingerafdruk vir identifikasie van prokariotiese en eukariotiese organismes.Deur voordeel te trek uit volgordebepaling, kan hierdie amplikone geteiken word op grond van die bewaarde dele en die hiperveranderlike streke kan volledig gekarakteriseer word vir mikrobiese identifikasie wat bydra tot studies wat mikrobiese diversiteitsanalise, taksonomie, filogenie, ens dek. Enkelmolekule intyds (SMRT) ) volgordebepaling van PacBio-platform maak dit moontlik om hoogs akkurate langlesings te verkry, wat vollengte-amplikone (ongeveer 1,5 Kb) kan dek.Die breër siening van genetiese veld het die resolusie in spesie-annotasie in bakterieë of swamme gemeenskappe aansienlik verbeter.
Platform:PacBio Vervolg II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplikonvolgordebepaling is daarop gemik om filogenie, taksonomie en spesie-oorvloed in 'n mikrobiese gemeenskap te openbaar deur PCR-produkte van huishoudelike genetiese merkers te ondersoek wat beide hoogs gekonfronteerde en hiperveranderlike dele bevat.Die bekendstelling van hierdie perfekte molekulêre vingerafdrukke deur Woeses et al, (1977) bemagtig isolasie-vrye mikrobioom profilering.Volgordebepaling van 16S (bakterieë), 18S (swamme) en Interne getranskribeerde spasieerder (ITS, swamme) laat identifikasie van beide volop spesies sowel as skaars en ongeïdentifiseerde spesies toe.Hierdie tegnologie het 'n wyd toegepaste en belangrike hulpmiddel geword om differensiële mikrobiese samestelling in verskeie omgewings te identifiseer, soos menslike mond, ingewande, ontlasting, ens.
Platform:Illumina NovaSeq6000
-
Hervolgordebepaling van die hele genoom van bakterieë en swamme
Hervolgordebepaling van bakteriële en swamheelgenoom is 'n kritieke hulpmiddel om die genome van bekende bakterieë en swamme te voltooi, asook om veelvuldige genome te vergelyk of om genome van nuwe organismes te karteer.Dit is van groot belang om hele genome van bakterieë en swamme te volgorde om akkurate verwysingsgenome te genereer, mikrobiese identifikasie en ander vergelykende genoomstudies te doen.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Swam genoom
Biomarker Technologies verskaf genoomopname, fyn genoom en pen-volledige genoom van swam, afhangende van spesifieke navorsingsdoelwit.Genoomvolgordebepaling, samestelling en funksionele annotasie kan bereik word deur Volgendegenerasievolgordebepaling + Derdegenerasievolgordebepaling te kombineer om hoëvlak genoomsamestelling te bereik.Hi-C tegnologie kan ook aangewend word om genoomsamestelling op chromosoomvlak te vergemaklik.
Platform:PacBio Vervolg II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Bakterie Voltooi Genoom
Biomarker Technologies verskaf volgordebepalingsdiens vir die konstruksie van volledige genoom van bakterieë met geen gaping nie.Hoofwerkvloei van bakterieë se volledige genoomkonstruksie sluit derde generasie volgordebepaling, samestelling, funksionele annotasie en gevorderde bioinformatiese analise in wat spesifieke navorsingsdoelwitte vervul.'n Meer omvattende profilering van bakterieë genoom bemagtig die onthulling van fundamentele meganismes onderliggend aan hul biologiese prosesse, wat ook waardevolle verwysing kan bied vir genomiese navorsing in hoër eukariotiese spesies
Platform:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Vervolg II
