Swam genoom
Diensvoordele
● Veelvuldige volgordebepalingstrategieë beskikbaar vir verskillende navorsingsdoelwitte
● Hoogs ervare in swam-genoomsamestelling met meer as 10 000 pene-volledige genoom saamgestel.
● Professionele na-verkope tegniese ondersteuningspan wat aan meer spesifieke navorsingsbehoeftes voldoen.
Diensspesifikasies
| Diens | Opeenvolgingstrategie | Kwaliteit gewaarborg | Geskatte omkeertyd |
| Swam fyn kaart | Illumina 50X + Nanopore 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 werksdae |
| PacBio HiFi 30X | |||
| Swampen-volledige kaart | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Chromosoomankerverhouding >90% | 45 werksdae |
Bioinformatika-ontledings
● Rou data kwaliteit beheer
● Genoomsamestelling
● Genoomkomponent-analise
● Geenfunksie-annotasie
● Vergelykende genomiese analise
Voorbeeldvereistes en aflewering
Voorbeeldvereistes:
VirDNA-ekstrakte:
| Voorbeeld tipe | Bedrag | Konsentrasie | Reinheid |
| DNA-ekstrakte | ＞ 1,2 μg | ＞ 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Vir weefselmonsters:
| Voorbeeld tipe | Aanbevole monsterbehandeling | Monsterberging en versending |
| Eensellige swam | Kyk na gis onder die mikroskoop en versamel dit in hul eksponensiële fase Plaas die kultuur (wat ongeveer 3-4.5e9-selle bevat) oor na 'n 1.5 of 2 ml eppendorf.(Hou op ys) Sentrifugeer die buis vir 1 min by 14000 g om bakterieë te versamel en verwyder die supernatant versigtig Seël die buis en vries die bakterieë in vloeibare stikstof vir ten minste 1-3 uur.Bêre die buis in -80 ℃ yskas. | Vries die monsters in vloeibare stikstof vir 3-4 uur en stoor in vloeibare stikstof of -80 grade tot langtermyn bespreking.Monsterversending met droë-ys word vereis. |
| Makroswam | Weefsel in aktief groeiende fase word aanbeveel. Spoel die weefsel uit met endotoksienvrye water, dan 70% etonaal. Stoor die monster in kriobuise. |
Dienswerkvloei
Voorbeeld aflewering
Biblioteek konstruksie
Opeenvolging
Data-analise
Na-verkope dienste
1. Circosdiagram op swamgenomiese komponente
2.Vergelykende genomika-analise: Filogenetiese boom
