BMKGENE het ruimtelike transkriptoomvolgordebepalingsdienste verskaf vir die studie “STEEL enables high-resolution delineation of spatiotemporal transcriptomic data”, wat in Briefings in Bioinformatics gepubliseer is.
Hierdie studie het 'n ontoesighoudende en veelvuldige leergebaseerde algoritme, Ruimtelike Transkriptoom seltipe groepering (STAAL), voorgestel wat domeine vanaf ruimtelike transkripoom identifiseer deur krale te groepeer wat beide hoogs soortgelyke geenuitdrukkingsprofiele en naby ruimtelike afstand in die wyse van grafieke vertoon.
'n Omvattende evaluering van STAAL op ruimtelike transkriptomiese datastelle vanaf die 10X Visium-platform toon dat dit nie net 'n hoë resolusie bereik om fyn strukture van die muisbrein te karakteriseer nie, maar ook die integrasie moontlik maak van veelvuldige weefselskyfies wat individueel ontleed word in 'n groter een.
Met die vooruitgang van ruimtelike transkripsietegnologieë, sal ons metode groot toepaslikheid hê in domeinidentifikasie en geenuitdrukking-atlas-rekonstruksie.
Klikhierom meer oor hierdie studie te wete te kom.
Postyd: 20 Okt-2023