Delf in die potensiaal om wilde verskeidenheid navorsingspesies te bestudeer, geïllustreer deur 'n deurslaggewende saak van BMKGENE se kliënte.Onlangs gepubliseer in vanjaar se uitgawe van die Plant Biotechnology Journal, die artikel getiteld "Chromosome-level Wild Hevea brasiliensis Genome: Empowering Genomic-Assisted Breeding and Unearthing Vital Loci for Elevated Rubber Yield" staan as 'n waardevolle verwysing.
Die Brasiliaanse rubberboom (Hevea brasiliensis) staan hoog as 'n belangrike natuurlike rubberbron.Deur die afgelope eeu het tradisionele teelmetodologieë 'n merkwaardige sesvoudige oplewing in rubberproduksie veroorsaak.Tog bly die onderliggende genetiese grondgesteente wat verantwoordelik is vir potensiële rubberopbrengsverhoging enigmaties.
Hierdie studie het begin met die konstruksie van 'n chromosoom-vlak genoom vir die wilde rubberboom, deur gebruik te maak van 'n sinergie van Nanopore-langleesvolgordebepaling, Illumina NGS-volgordebepaling en Hi-C-tegnologie.
Terselfdertyd is 'n versameling van 147 kiemplasma-hulpbronne, wat hoë-opbrengsvariasies, wilde stamme en verwante spesies insluit, saamgestel vir omvattende geheelgenoomherrangskikking (WGS) met behulp van die Illumina-platform.Die daaropvolgende volgordebepalingsdata het streng bevolkingsgenetika-analise ondergaan, wat die disseksie van populasiestruktuur, diversiteit en koppelingsonewewig moontlik gemaak het.Hierdie ontleding het lig gewerp op huishoudelike variasies oor bevolkings heen.
Verdere ondersoeke het analise ingesluit wat Fst, π, Tajima's D en LD insluit, met die doel om seleksieseine te onthul wat voortspruit uit verbeterde latex-opbrengs, veral met die fokus op Wickham-klone.
Met 'n genoomwye assosiasie-analise (GWAS), is merkers wat aan opbrengs-eienskappe gekoppel is en gevolglik opbrengsverwante gene vasgestel.Aanvanklike validering het kenmerkende transkripsieaktiwiteite oor verskillende mutante vir twee ERF-gene onthul, wat 'n voorlopige blik op hul funksionele betekenis verskaf het.Verdere bevestiging word binne komende navorsing geskeduleer.
BMKGENE is trots daarop om by te dra tot die uitgebreide hele genoom hervolgordebepaling van hierdie aansienlike populasie, tesame met 'n aansienlike rol in die bioinformatika-analise.Ons uitgebreide ervaring sluit NGS/TGS-volgordebepaling en multiomika bioinformatika-analise in oor 'n verskeidenheid van 1000+ spesies.Ons sien uit na die vooruitsig om met jou saam te werk oor jou komende projekte.
Klik hier omleer meer oor hierdie studie
Postyd: Aug-29-2023