● Hoogs ervare: Meer as 200 000 monsters is in BMK verwerk wat diverse monstertipes dek, insluitend selkultuur, weefsel, liggaamsvloeistof, ens. en meer as 7 000 mRNA-Seq-projekte gesluit wat verskeie navorsingsareas dek.
● Streng gehaltebeheerstelsel: Kerngehaltebeheerpunte deur alle stappe, insluitend monstervoorbereiding, biblioteekvoorbereiding, volgordebepaling en bioinformatika, word noukeurig gemonitor om hoë gehalte resultate te lewer.
● Veelvuldige databasisse beskikbaar vir funksie-aantekeninge en verrykingstudies om diverse navorsingsdoelwitte te bereik.
● Na-verkope dienste: Na-verkope dienste geldig vir 3 maande na projek voltooiing, insluitend projekte opvolg, foutsporing, resultate V&A, ens.
Biblioteek | Opeenvolgingstrategie | Data aanbeveel | Kwaliteitsbeheer |
Poly A verryk | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Nukleotiede:
Kons.(ng/μl) | Hoeveelheid (μg) | Reinheid | Integriteit |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Beperkte of geen proteïen- of DNA-kontaminasie word op gel gewys. | Vir plante: RIN≥6.5; Vir diere: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; beperkte of geen basislyn hoogte nie |
Weefsel: Gewig (droog):≥1 g
*Vir weefsel kleiner as 5 mg, beveel ons aan om flitsbevrore (in vloeibare stikstof) weefselmonster te stuur.
Selsuspensie:Seltelling = 3×106- 1×107
*Ons beveel aan om bevrore sellisaat te stuur.As daardie sel kleiner as 5×105 tel.
Bloedmonsters:Volume≥1 ml
Mikro-organismes:Massa ≥ 1 g
Houer: 2 ml sentrifugeerbuis (tinfoelie word nie aanbeveel nie)
Monsteretikettering: Groep+repliseer bv. A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
Versending:
Bioinformatika
Eukarioties mRNA volgordebepaling analise werkvloei
Bioinformatika
ØRou data kwaliteit beheer
ØVerwysing genoombelyning
ØTranskripsiestruktuuranalise
ØUitdrukking kwantifisering
ØDifferensiële uitdrukking analise
ØFunksie annotasie en verryking
1.mRNA Data Versadigingskurwe
2.Differensiële uitdrukking analise-Vulkaan plot
3.KEGG-aantekening op DEG's
4.GO-klassifikasie op DEG's