BMKMANU S1000 Ruimtelike Transkriptoom
BMKMANU S1000 Ruimtelike Transkriptoom Tegniese Skema
Voordele van BMKMANU S1000
1) Sub-sellulêre resolusie: Elke vangarea het >2 miljoen ruimtelike strepiesgekodeerde kolle bevat met 'n deursnee van 2.5 µm en 'n spasiëring van 5 µm tussen kolsentrums, wat ruimtelike transkriptoomanalise met sub-sellulêre resolusie (5 µm) moontlik maak.
2) Multi-vlak resolusie-analise: Buigsame multi-vlak-analise wat wissel van 100 μm tot 5 μm om diverse weefselkenmerke teen optimale resolusie op te los.
3) Omvattende transkriptoom-profilering: Transkripsies wat van die hele weefselskyfie vasgevang is, kan ontleed word, sonder beperking op die aantal teikengene en teikenarea.
Diensspesifikasies
| Biblioteek | Opeenvolgingstrategie | Data-uitvoer aanbeveel |
| S1000 cDNA-biblioteek | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60 Gb/monster |
Voorbeeldvereistes
| Voorbeeld | Nommer | Grootte | RNA kwaliteit |
| OCT ingebedde weefselblok | 2-3 blokke/monster | Ongeveer.6,8x6,8x6,8 mm3 | RIN≥7 |
Vir meer besonderhede oor voorbeeldvoorbereidingsleiding en dienswerkvloei, praat gerus met aBMKGENE deskundige
Dienswerkvloei
Eksperiment ontwerp
Voorbeeld aflewering
Voor-eksperiment
Ruimtelike strepieskodering
Biblioteek konstruksie
Opeenvolging
Data-analise
Na-verkope dienste
Die data wat deur BMKMANU S1000 gegenereer word, word ontleed met behulp van die sagteware "BSTMatrix", wat onafhanklik deur BMKGENE ontwerp is, insluitend:
1) Geenuitdrukking matriksgenerering
2) HE beeldverwerking
3) Versoenbaar met stroomaf derdeparty-sagteware vir ontleding
4) Aanlyn “BSTViewer” help om visualiseringsresultate by verskillende resolusies te verkry.
1.Vlekgroepering
2. Ruimtelike verspreiding
Nopmerking: Resolusievlak=13 (100 µm, links); 7 (50 µm, regs)
3. Merker uitdrukking oorvloed groepering hittekaart
4.Inter-steekproef data-analise
